Pues en otro foro al hacerme mas preguntas me han dado una pista de lo que provocava mi error, tenia instalada la extensión Joomla Tags, y al haber unos quantos no sabia provocar un salto de linea y esto generaba que el texto saliera de la plantilla. Comprueba que no sea alguna extension.
Otras opciones que me han comentado era si habia fotos, y en mi caso habia articulos que si (extension phoca) y otros que no. Si había copiado y pegado el texto, igual que las fotos, casos que si otros que no.
No se si te sera de mucha ayuda, espero que sí, ahora me toca buscar otra extension de tags que me guste.
Un saludo
